Curso ENSAMBLE

Curso básico de manejo de ENSAMBLE

ENSAMBLE es una base de datos europea que tiene información de todos los datos de genética, epigenética que se disponen en este momento. Es una herramienta que se está convirtiendo en indispensable para muchos tipos de investigación: cáncer, envejecimiento, fertilidad, antropología, criminología, migraciones animales, evolución, etc. El objetivo de este curso es adquirir el conocimiento del manejo de estas bases de datos. En este primer curso se propone una visión general y básica de todas las posibilidades de esta base de datos en un curso impartido en tres días. Las clases se impartirán en inglés.

Temario:

Two days full teaching divided into the following modules:

  • Introduction to Ensemble.
  • Exploring regions of the genome.
  • Exploring gene and transcript annotation.
  • The BioMart data export tool.
  • Variation data and the Variant Effect Predictor, including the 1000 Genomes Project.
  • Regulation: Sequences involved in gene regulation, including an intro to ENCODE, BluePrint and RoadMap Epigenomics.
  • Custom data upload.

Profesorado:

  • Dr. Been Moore, European Informatic Institute (EMBL-EBI), Cam,bridge, UK.
  • Dra. África García-Orad, Dpto. Genética, Antropología Física y Fisiología Animal. Dr. Ramón Bilbao, Dpto. Genética, Antropología Física y Fisiología Animal.
  • Dra. Idoia Martín Guerrero, Dpto. Genética, Antropología Física y Fisiología Animal.
  • Dra. Izortze Santin, Dpto. Pediatría.

Calendario:

2, 3, 4 y 5 de Octubre 2017. Total 16 h (teoría + ejercicios), 4 h no presenciales.

Horario: 15:30-19:30 h.

Lugar de impartición:

Facultad Medicina y Enfermería (local a especificar).

Inscripción:

Hoja de inscripción