ENEDI taldeak bi masterretan parte hartzen du, horietako bat master ofiziala da eta bestea Erasmus Mundus masterra, biak doktorego-ikasketak egiteko gaitzen dutenak. Gainera, ondorengo etapa batean, ENEDI unibertsitate arteko doktorego-programa batean parte hartzen ari da, Vigoko eta Burgoseko unibertsitateekin batera.