Telefono: 94 601 8072
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Grupo de Investigación: BIOLOGÍA MOLECULAR DEL CÁNCER

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• Producción Científica

Desde 2007 soy Profesor en la Facultad de Medicina y Odontología de la Universidad del País Vasco (UPV/EHU). Imparto docencia en las asignaturas Medical Genetics, Introducción a la Investigación Biomédica y Proyecto de Investigación. Además soy profesor y coordinador del Curso Molecular Bases of Cell Proliferation, Differentiation and Death en el Máster en Biología Molecular y Biomedicina de la UPV/EHU y la Universidad de Cantabria. 

Antes de incorporarme a la UPV/EHU, entre 2001 y 2006, mi actividad docente se desarrolló  en el Departamento de Oncología Médica de la Vrije Universiteit de Ámsterdam (Holanda), colaborando en el  Máster en Oncología y en la supervisión de estudiantes.

Obtuve mi Doctorado en la Facultad de Medicina de la Universidad del País Vasco (UPV/EHU) en 1998 con un estudio sobre los factores genéticos en la carcinogénesis cervical inducida por el virus HPV. Tras finalizar la Tesis obtuve una beca Postdoctoral del Departamento de Educación de Gobierno Vasco con la que inicié mi trabajo posdoctoral en el Westmead Institute for Cancer Research en Sydney, Australia. He llevado a cabo trabajos de investigación sobre los mecanismos moleculares de la transformación maligna durante 9 años en varios centros de investigación oncológica de referencia en Australia, Holanda y Estados Unidos. He publicado más de 50 artículos en revistas de investigación y soy Director/Codirector de cuatro Tesis Doctorales finalizadas y dos en curso.

En 2007, con mi llegada a la UPV/EHU, me reincorporé al Sistema Vasco de Ciencia y Tecnología. Gracias a la financiación del MICINN, el Gobierno Vasco (Programas Saiotek y Etortek) y la Universidad, he establecido una nueva línea de investigación sobre los mecanismos moleculares del cáncer. En concreto, nuestros trabajos actuales se centran en dos procesos básicos que se encuentran alterados en las células tumorales: la ubiquitinación de proteínas y el transporte nucleocitoplásmico. Nuestro objetivo último es contribuir al desarrollo de nuevas terapias dirigidas contra el cáncer.

Soy vocal en el Comité de Ética en la Investigación con Agentes Biológicos (CEIAB) de la UPV/EHU y miembro de la Junta Directiva de la Asociación Española de Investigación sobre el Cáncer (ASEICA).

Colaboro con diferentes grupos de Investigación tanto nacionales como internacionales y nuestro grupo forma parte de una Acción Europea COST (PROTEOSTASIS) recientemente aprobada para promover el intercambio y colaboración entre grupos interesados en la regulación de las proteínas por mecanismos relacionados con la ubiquitinación.

1: Prieto G, Rodríguez JA, Fullaondo A. Enhancing prediction of short linear
protein motifs with Wregex 3.0. Comput Struct Biotechnol J. 2024 Jul
17;23:2978-2984. doi: 10.1016/j.csbj.2024.07.013. PMID: 39135888; PMCID:
PMC11318550.

2: Chaudhry S, Beckedorff F, Jasdanwala SS, Totiger TM, Affer M, Lawal AE,
Montoya S, Tamiro F, Tonini O, Chirino A, Adams A, Sondhi AK, Noudali S,
Cornista AM, Nicholls M, Afaghani J, Robayo P, Bilbao D, Nimer SD, Rodríguez JA,
Bhatt S, Wang E, Taylor J. Altered RNA export by SF3B1 mutants confers
sensitivity to nuclear export inhibition. Leukemia. 2024 Sep;38(9):1894-1905.
doi: 10.1038/s41375-024-02328-1. Epub 2024 Jul 13. PMID: 38997434; PMCID:
PMC11347370.

3: Arroyo-Berdugo Y, Sendino M, Greaves D, Nojszewska N, Idilli O, So CW, Di
Silvio L, Quartey-Papafio R, Farzaneh F, Rodriguez JA, Calle Y. High Throughput
Fluorescence-Based In Vitro Experimental Platform for the Identification of
Effective Therapies to Overcome Tumour Microenvironment-Mediated Drug Resistance
in AML. Cancers (Basel). 2023 Mar 27;15(7):1988. doi: 10.3390/cancers15071988.
PMID: 37046649; PMCID: PMC10093176.

4: Barroso-Gomila O, Muratore V, Merino-Cacho L, Rodriguez JA, Barrio R,
Sutherland JD. Studying the ubiquitin code through biotin-based labelling
methods. Semin Cell Dev Biol. 2022 Dec;132:109-119. doi:
10.1016/j.semcdb.2022.02.009. Epub 2022 Feb 16. PMID: 35181195.

5: Elu N, Osinalde N, Ramirez J, Presa N, Rodriguez JA, Prieto G, Mayor U.
Identification of substrates for human deubiquitinating enzymes (DUBs): An up-
to-date review and a case study for neurodevelopmental disorders. Semin Cell Dev
Biol. 2022 Dec;132:120-131. doi: 10.1016/j.semcdb.2022.01.001. Epub 2022 Jan 15.
PMID: 35042675.

6: Giordano I, Pirone L, Muratore V, Landaluze E, Pérez C, Lang V, Garde-Lapido
E, Gonzalez-Lopez M, Barroso-Gomila O, Vertegaal ACO, Aransay AM, Rodriguez JA,
Rodriguez MS, Sutherland JD, Barrio R. SALL1 Modulates CBX4 Stability, Nuclear
Bodies, and Regulation of Target Genes. Front Cell Dev Biol. 2021 Sep
21;9:715868. doi: 10.3389/fcell.2021.715868. PMID: 34621739; PMCID: PMC8490708.

7: López DJ, Rodríguez JA, Bañuelos S. Molecular Mechanisms Regulating the DNA
Repair Protein APE1: A Focus on Its Flexible N-Terminal Tail Domain. Int J Mol
Sci. 2021 Jun 11;22(12):6308. doi: 10.3390/ijms22126308. PMID: 34208390; PMCID:
PMC8231204.

8: Ramirez J, Prieto G, Olazabal-Herrero A, Borràs E, Fernandez-Vigo E,
Alduntzin U, Osinalde N, Beaskoetxea J, Lectez B, Aloria K, Rodriguez JA,
Paradela A, Sabidó E, Muñoz J, Corrales F, Arizmendi JM, Mayor U. A Proteomic
Approach for Systematic Mapping of Substrates of Human Deubiquitinating Enzymes.
Int J Mol Sci. 2021 May 3;22(9):4851. doi: 10.3390/ijms22094851. PMID: 34063716;
PMCID: PMC8124392.

9: Bozal-Basterra L, Gonzalez-Santamarta M, Muratore V, Martín-Martín N, Ercilla
A, Rodríguez JA, Carracedo A, Sutherland JD, Barrio R. LUZP1 Controls Cell
Division, Migration and Invasion Through Regulation of the Actin Cytoskeleton.
Front Cell Dev Biol. 2021 Apr 1;9:624089. doi: 10.3389/fcell.2021.624089. PMID:
33869174; PMCID: PMC8049182.

10: Olazabal-Herrero A, Bilbao-Arribas M, Carlevaris O, Sendino M, Varela-
Martinez E, Jugo BM, Berra E, Rodriguez JA. The dystrophia myotonica WD repeat-
containing protein DMWD and WDR20 differentially regulate USP12 deubiquitinase.
FEBS J. 2021 Oct;288(20):5943-5963. doi: 10.1111/febs.15875. Epub 2021 Apr 28.
PMID: 33844468.

11: Urizar-Arenaza I, Benedicto A, Perez-Valle A, Osinalde N, Akimov V, Muñoa-
Hoyos I, Rodriguez JA, Asumendi A, Boyano MD, Blagoev B, Kratchmarova I, Subiran
N. The multifunctional role of SPANX-A/D protein subfamily in the promotion of
pro-tumoural processes in human melanoma. Sci Rep. 2021 Feb 11;11(1):3583. doi:
10.1038/s41598-021-83169-1. PMID: 33574425; PMCID: PMC7878863.

12: Rodriguez JA. The "STK38-XPO1 axis": its general relevance and mechanistic
underpinnings remain to be further characterized. Cell Mol Life Sci. 2021
May;78(9):4451-4452. doi: 10.1007/s00018-021-03778-x. Epub 2021 Feb 9. PMID:
33559690; PMCID: PMC11072521.

13: Olazagoitia-Garmendia A, Zhang L, Mera P, Godbout JK, Sebastian-DelaCruz M,
Garcia-Santisteban I, Mendoza LM, Huerta A, Irastorza I, Bhagat G, Green PH,
Herrero L, Serra D, Rodriguez JA, Verdu EF, He C, Bilbao JR, Castellanos-Rubio
A. Gluten-induced RNA methylation changes regulate intestinal inflammation via
allele-specific <i>XPO1</i> translation in epithelial cells. Gut. 2022
Jan;71(1):68-76. doi: 10.1136/gutjnl-2020-322566. Epub 2021 Feb 1. PMID:
33526437; PMCID: PMC8666699.

14: Sendino M, Omaetxebarria MJ, Prieto G, Rodriguez JA. Using a Simple Cellular
Assay to Map NES Motifs in Cancer-Related Proteins, Gain Insight into
CRM1-Mediated NES Export, and Search for NES-Harboring Micropeptides. Int J Mol
Sci. 2020 Sep 1;21(17):6341. doi: 10.3390/ijms21176341. PMID: 32882917; PMCID:
PMC7503480.

15: López DJ, Rodríguez JA, Bañuelos S. Nucleophosmin, a multifunctional
nucleolar organizer with a role in DNA repair. Biochim Biophys Acta Proteins
Proteom. 2020 Dec;1868(12):140532. doi: 10.1016/j.bbapap.2020.140532. Epub 2020
Aug 25. PMID: 32853771.

16: Bozal-Basterra L, Gonzalez-Santamarta M, Muratore V, Bermejo-Arteagabeitia
A, Da Fonseca C, Barroso-Gomila O, Azkargorta M, Iloro I, Pampliega O, Andrade
R, Martín-Martín N, Branon TC, Ting AY, Rodríguez JA, Carracedo A, Elortza F,
Sutherland JD, Barrio R. LUZP1, a novel regulator of primary cilia and the actin
cytoskeleton, is a contributing factor in Townes-Brocks Syndrome. Elife. 2020
Jun 18;9:e55957. doi: 10.7554/eLife.55957. PMID: 32553112; PMCID: PMC7363444.

17: Urizar-Arenaza I, Osinalde N, Akimov V, Puglia M, Muñoa-Hoyos I, Gianzo M,
Rodriguez JA, Ganzabal T, Blagoev B, Kratchmarova I, Subiran N. SPANX-A/D
protein subfamily plays a key role in nuclear organisation, metabolism and
flagellar motility of human spermatozoa. Sci Rep. 2020 Mar 27;10(1):5625. doi:
10.1038/s41598-020-62389-x. PMID: 32221341; PMCID: PMC7101357.

18: Taylor J, Sendino M, Gorelick AN, Pastore A, Chang MT, Penson AV, Gavrila
EI, Stewart C, Melnik EM, Herrejon Chavez F, Bitner L, Yoshimi A, Lee SC, Inoue
D, Liu B, Zhang XJ, Mato AR, Dogan A, Kharas MG, Chen Y, Wang D, Soni RK,
Hendrickson RC, Prieto G, Rodriguez JA, Taylor BS, Abdel-Wahab O. Altered
Nuclear Export Signal Recognition as a Driver of Oncogenesis. Cancer Discov.
2019 Oct;9(10):1452-1467. doi: 10.1158/2159-8290.CD-19-0298. Epub 2019 Jul 8.
PMID: 31285298; PMCID: PMC6774834.

19: Elu N, Osinalde N, Beaskoetxea J, Ramirez J, Lectez B, Aloria K, Rodriguez
JA, Arizmendi JM, Mayor U. Detailed Dissection of UBE3A-Mediated DDI1
Ubiquitination. Front Physiol. 2019 May 3;10:534. doi: 10.3389/fphys.2019.00534.
PMID: 31130875; PMCID: PMC6509411.

20: Olazabal-Herrero A, Sendino M, Arganda-Carreras I, Rodríguez JA. WDR20
regulates shuttling of the USP12 deubiquitinase complex between the plasma
membrane, cytoplasm and nucleus. Eur J Cell Biol. 2019 Jan;98(1):12-26. doi:
10.1016/j.ejcb.2018.10.003. Epub 2018 Nov 3. PMID: 30466959.