PRIMER CURSO DEL GRADO DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
PRIMER CURSO DEL GRADO DE BIOTECNOLOGÍA
METODOLOGÍA
BIOQUÍMICA BÁSICA
*******************
APUNTES
(CURSO 2021-2022)
problemas |
PRIMER CURSO DEL GRADO DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR PRIMER CURSO DEL GRADO DE BIOTECNOLOGÍA | |
| METODOLOGÍA BIOQUÍMICA BÁSICA ******************* APUNTES (CURSO 2021-2022) |
| TEMARIO Tema 1.- Artículos y revistas científicas: Artículos científicos. Tipos de artículos. Tipos de revistas científicas. Factor de impacto. Revistas en formato electrónico. Estructura de un manuscrito científico. Cómo se publica un artículo de investigación. Tema 2.- Búsqueda bibliográfica: Bases de datos de artículos científicos. MEDLINE, PubMed y PubMed Central. Estructura de un registro de MEDLINE. El motor de búsqueda de PubMed. Cómo conseguir una copia de un artículo científico. Bibliometría: la Web of Science, el Journal of Citation Reports y Science Citation Index. Tema 3.- La investigación en bioquímica: El método científico. Planteamiento de una hipótesis. Diseño experimental. La metodología analítica. Tipos de experimentos. Niveles de experimentación en bioquímica: estudios con animales intactos, con órganos, tejidos o células aisladas. Estudios moleculares (estructurales o funcionales). Fundamento de los métodos bioquímicos. El cuaderno de laboratorio. Tratamiento de los resultados. Elaboración de conclusiones. Consideraciones éticas. Tema 4.- Buenas prácticas en un laboratorio de bioquímica: Identificación de peligros (físicos, químicos, biológicos y radiológicos). Medidas de seguridad generales y personales. Normativas de seguridad. Comportamiento en situaciones de emergencia. Tema 5.- Sistemas celulares: Cultivos celulares. Líneas celulares. Técnicas para la separación de diferentes tipos celulares (centrifugación, elutriación centrífuga, citometría de flujo). Cuantificación y viabilidad celular. El hemocitómetro. Tema 6.- Centrifugación y Fraccionamiento subcelular: Métodos para la homogeneización y obtención del extracto crudo. Centrifugación preparativa (diferencial y en gradiente de densidad). Enzimas marcadores para identificar los diversos orgánulos celulares. Viabilidad de los orgánulos. Centrifugación analítica. Tema 7.- Cromatografía. Conceptos básicos y principios generales. Técnicas cromatográficas basadas en la polaridad (cromatografía líquido-sólido, cromatografía gas-líquido, cromatografía líquido-líquido). Técnicas cromatográficas basadas en la carga (cromatografía de intercambio iónico). Técnicas cromatográficas basadas en el tamaño (cromatografía de tamizado molecular). Cromatografía de afinidad. Tema 8.- Técnicas electroforéticas. Conceptos básicos y principios generales. Soportes electroforéticos. Métodos de tinción. Electroforesis en gradiente. Electroforesis en gel de poliacrilamida en presencia de SDS. Isoelectroenfoque. Electroforesis bidimensional. Electroforesis capilar. Tema 9.- Técnicas espectrofotométricas. Conceptos básicos y principios generales. Cromóforos en bioquímica. Coeficiente de absorción molar. La ley de Lambert-Beer. Instrumentación: espectroscopía visible y ultravioleta. Tema 10.- Diseño de un ensayo enzimático. Métodos para la cuantificación de la actividad catalítica. Determinación experimental de los parámetros cinéticos. Tema 11.- Técnicas radioquímicas. Átomos e isótopos. Desintegración radioactiva. Tipos de emisiones radioactivas. Unidades de radioactividad. Detección y medida de radioactividad. Tema 12.- Técnicas inmunoquímicas. Anticuerpos. Interacción antígeno-anticuerpo. Anticuerpos policlonales y monoclonales. Marcaje de anticuerpos. Inmunoprecipitación. Inmunoensayos (RIA, IRMA, ELISA). Tema 13.- Técnicas de hibridación. Desnaturalización y renaturalización del ADN. Efectos hipocrómico e hipercrómico. Preparación y marcaje de sondas. Hibridación de ácidos nucleicos. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR). RTPCR. Chips de ADN. Tema 14-. Técnicas de identificación (blotting). Conceptos básicos. Transferencia (blotting). Southern blot. Northern blot. Western-blot. Dot-blot. |
ENLACES
El
método definitivo para tomar notas a mano, según la Universidad de Cornell
(El Confidencial del 21-1-2015) (
)
CURSO DE BIOMOLÉCULAS
EN INTERNET 
| Artículos y revistas científicas. Artículos científicos. Tipos de artículos. Tipos de revistas científicas. Factor de impacto. Revistas en formato electrónico. Estructura de un manuscrito científico. Cómo se publica un artículo de investigación. |
APUNTES
Artículos
científicos .........................................................................
ENLACES
1.- Instrucciones para los autores
2.- Ejemplo de manuscrito científico aceptado por una revista
3.- Siete consejos de escritura para científicos
4.- Nombres resumidos de las revistas científicas
5.- PubMed Central: Una base de datos de artículos científicos
¡¡¡ PON A PRUEBA TUS CONOCIMIENTOS !!!
(Cada icono es un miniexamen de 5 preguntas)
| Búsqueda bibliográfica. Bases de datos de artículos científicos. MEDLINE, PubMed y PubMed Central. Estructura de un registro de MEDLINE. El motor de búsqueda de PubMed. Cómo conseguir una copia de un artículo científico. Bibliometría: La Web of Science, el Journal of Citation Reports y Science Citation Index. |
APUNTES
Búsqueda bibliográfica .........................................................................
Cienciometría y bibliometría (la
Web of Science) ...................................
PRESENTACIONES
PubMed ..............................................................................................
Bibliometría: La Web of Science (WOS).................................................
Journal Citation Reports (JCR).............................................................
Science Citation Index (SCI).................................................................
BIBLIOGRAFÍA
PubMed: The Bibliographic Database .............................................................................
PubMed Central (PMC): An Archive for Literature from Life Science
Journals...................
Manual de uso de PubMed (En inglés, muy completo).......................................................
Ejemplo de carta para pedir un artículo a los autores
........................................................
ENLACES
1.- Búsqueda bibliográfica (la práctica de ordenador)
2.- PubMed -- Ayuda para utilizar PubMed -- Tutoriales de PubMed (Quick Tours)
3.- Ejemplo de un registro MEDLINE en PubMed
4.- Descripción de los campos de un registro PubMed (NCBI Web site)
5.- PubMed Central (Base de datos de artículos científicos)
6.- Science Direct (Gestor de acceso a las publicaciones científicas)
7.- SCI-HUB
(Página para descargar artículos científicos de forma gratuita)
8.- BookSC
(Página para descargar artículos científicos de forma gratuita)
9.- Clarivate (Empresa que elabora el JCR y la Web of Science)
10.- Acceso al JCR: desde
Clarivate - desde
la página web del Ministerio (primero entras en la WOS) - desde
la página web de la biblioteca de la UPV
11.- Acceso al SCI: desde Clarivate - desde la página web del Ministerio (WOS)
12.- Acceso a SCOPUS: desde SCOPUS - desde la página web del Ministerio
NOTICIAS
1.- Elsevier paralizó una ley clave para proteger su millonario monopolio en España (El Confidencial 21-2-2018)
2.- Esto es lo que cuestan las revistas científicas: España se ha pulido 213 millones desde 2012 (El Confidencial 16-2-2018)
3.- El secreto mejor guardado de Elsevier: nos cobra por revistas gratuitas que nadie lee (El Confidencial 16-3-2018)
4.- Radical open-access plan could spell end to journal subscriptions (Nature 4-9-2018)
5.- Open sesame (The economist, 14-4-2012)
6.- History of Citation Indexing (Clarivate Analytics)
1.- Web
of Scence Training (Colección de videos explicativos para utilizar
la WOS)
¡¡¡ PON A PRUEBA TUS CONOCIMIENTOS !!!
(Cada icono es un miniexamen de 5 preguntas)
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La investigación en bioquímica.
El método científico.
Planteamiento de una hipótesis. Diseño experimental. La metodología
analítica. Tipos de experimentos. Niveles de experimentación
en bioquímica: estudios con animales intactos, con órganos, tejidos
o células aisladas. Estudios moleculares (estructurales o funcionales).
Fundamento de los métodos
bioquímicos. El cuaderno de laboratorio.
Tratamiento de los resultados. Elaboración de conclusiones. Consideraciones
éticas.
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APUNTES
El
método científico ........................................................................
El cuaderno de laboratorio ...............................................................
BIBLIOGRAFÍA
1.-
El cuaderno de laboratorio ()
2.- Preparación de Informes y Cuadernos de Laboratorio ()
3.-
Decálogo del cuaderno de laboratorio ()
4.-
El cuaderno de laboratorio. Guía de buenas prácticas ()
ENLACES
1.- Wikipedia: El método científico - El método hipotético-deductivo -- Ciclo de la investigación científica -- El método empírico-analítico --
3.- Preparación de informes y cuaderno de laboratorio
4.- Utilización del cuaderno de laboratorio (Guía Básica)
7.- Organismos
modelo más estudiados en los laboratorios de bioquímica (CSIC)
8.- Artículo publicado en "El Confidencial" el 6-9-2015: "Así funciona el método científico: claves para que no te timen con un 'estudio' de chichinabo"
VIDEOS
¡¡¡ PON A PRUEBA TUS CONOCIMIENTOS !!!
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¡¡¡ PON A PRUEBA TU MENTE !!!
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| Buenas prácticas en un laboratorio de Bioquímica. Identificación de peligros (físicos, químicos, biológicos y radiológicos). Medidas de seguridad generales y personales. Normativas de seguridad. Comportamiento en situaciones de emergencia |
APUNTES
Seguridad
()
Peligros químicos ()
PRESENTACIONES
Seguridad
(
)
Peligros físicos ()
Peligros causados por radiaciones ()
Peligros de los equipos de laboratorio ()
Peligros químicos ()
Peligro biológico 1 ()
- Peligro biológico 2 ()
BIBLIOGRAFÍA
Manual de Supervivencia en el laboratorios (Universidad de Alicante)..................
Manual de Seguridad y Salud en Laboratorios (Fremap) .....................................
Manual
de Seguridad en Laboratorios Químicos (Panreac) ............................
Buenas
Prácticas de laboratorio (CSIC)................................................................
Guía
de Seguridad e Higiene en el Laboratorio (Universidad de Vigo) ..................
Manual
de bioseguridad en el laboratorio (OMS) ..................................................
Bioseguridad
en laboratorios de microbiología y biomedicina (CDC).....................
Cabinas
de seguridad biológica: uso, desinfección y mantenimiento .......................
ENLACES
1.- Clasificación
de los productos químicos en función de su peligosidad ()
2.- Ejemplo
de una ficha de datos de seguridad (ácido sulfúrico) ()
3.- Listado
de Frases R y S ()
4.- Identificación de materiales peligrosos (rombo NFPA)
5.-
Manual preventivo (Universidad Politécnica de Valencia) ()
6.- Manual
de supervivencia en el laboratorio (Universidad de Alicante) ()
7.- Lab
Safety Do's and Dont's for Students
8.- Pictogramas
CLP - Reglamento
CLP
9.- Biosafety
in microbiological and biomedical laboratories (CDC)
10.- Recognizing
the biosafety levels - Quick learn lesson (CDC)
11.- El
laboratorio de biotecnología (monografías.com)
12.- Radiaciones ionizantes y radiaciones no ionizantes
VÍDEOS
1.- La seguridad en los laboratorios
químicos
2.-
Gestión de residuos en laboratorios químicos
3.- Safe
handling of laboratory glassware
4.- Colección de vídeos sobre bioseguridad (en inglés)
5.- Take
a look inside the world's most biosecure laboratory
6.- Visita
un laboratorio BSL-4 (BioSafety Level 4)
- NEIDL:
Biosafety level 4 - Level
4 Laboratories -
7.- How scientists enter and exit BSL-4 laboratories
8.- Working
Safely BSC (Colección de 8 vídeos sobre CSB)
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| Cultivos celulares. Líneas celulares. Técnicas para la separación de diferentes tipos celulares (centrifugación, elutriación centrífuga, citometría de flujo). Cuantificación y viabilidad celular. El hemocitómetro. |
APUNTES
Cultivos
celulares ....................................
Separación
de células ...............................
(El Power Point incluye un video: video
1 )
Recuento de células y viabilidad .......................
(El Power Point incluye tres videos: vídeo
1 - video 2 - video
3 )
LIBROS
Culture of animal cells (pincha aquí
para descargar)
POWER POINTS
100
años de cultivos celulares (Cultek)
-- Cultivos
celulares --
ANIMACIONES
1.- Flow
cytometry
2.- Introduction
to flow cytometry (Web-based training)
ENLACES
1910 to 1923 - Carrel and the early days of tissue culture
Introducción al cultivo de tejidos -- Cultivo celular (Wikipedia) -- Cultivos celulares --
Tissue culture (what-when-how)
Cultivos
celulares (pdf)(Cultek) --
Cultivos
celulares (pdf) -- Cell
culture (Cell Biology Wiki)
Cell Counter (Wikipedia) -- Hemocytometer (Wikipedia) -- Hemocytometer calculator
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| Centrifugación y Fraccionamiento subcelular. Métodos para la homogeneización y obtención del extracto crudo. Centrifugación preparativa (diferencial y en gradiente de densidad). Enzimas marcadores para identificar los diversos orgánulos celulares. Viabilidad de los orgánulos. Centrifugación analítica. |
APUNTES
Centrifugación ....................................
Fraccionamiento subcelular (En inglés, pero muy
bueno )
...................................
MATERIAL BIBLIOGRÁFICO
Notas sobre Centrifugación
(Universidad de Alcalá de Henares).......................................
Introduction to analytical centrifugation ...........................................................................
ANIMACIONES
1.- Animación sobre la separación de moléculas en un gradiente de densidad
2.- Animación de fraccionamiento celular. Excelente. Con sonido. En inglés.
3.- Animación del experimento de Meselson y Stahl. En este experimento biológico clásico, se utilizó la centrifugación en un gradiente de densidad de Cloruro de Cesio para demostrar que la replicación del DNA tenía lugar de forma semiconservativa.
ENLACES
1.- Cuestiones básicas sobre la centrifugación (en inglés)
2.- Calculadora que convierte las RPM en g y viceversa según el tipo de rotor - Otra calculadora (ENDMEMO)
3.- Centrifugation
separations (Sidma-Aldlrich)
4.- Safe
use of centrifuges (Eppendorf)
VIDEOS
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| Diseño de un ensayo enzimático. Métodos para la cuantificación de la actividad catalítica. Determinación experimental de los parámetros cinéticos. |
APUNTES SOBRE ENZIMAS
Enzimas ................