La Junta de Facultad es el órgano colegiado máximo del Centro, presidida por el Decano o Decana y formada por el Equipo Decanal, la Administradora de Centro y un número de miembros electos de los diferentes colectivos que lo conforman. Sus actividades se rigen por el artículo 202 de los Estatutos de la UPV/EHU y están reguladas por el Reglamento de Centro , siendo de su competencia, entre otras, la elección de Decano o Decana, elaboración y modificación de planes de estudio, propuestas de contratación de profesorado, distribución del presupuesto y ordenación académica. Se reúne como mínimo una vez por semestre y de forma extraordinaria cuantas veces sea necesario.