La Dirección de Gestión de Investigación es la unidad encargada de la coordinación de la actividad investigadora de la UPV/EHU. La Dirección se encarga de la gestión de proyectos y grupos de investigación propios, autonómicos y estatales, la incorporación de personal de investigación en formación y de personal investigador contratado y además de las convocatorias de infraestructuras de investigación.

Además en la Unidad de investigación se evalúa la producción científica de los departamentos e institutos de investigación universitarios. Como actividad complementaria la Dirección da soporte a la Comisión de Investigación, Desarrollo e Innovación y a la Comisión de Ética de la UPV/EHU.