El Departamento de Biología Celular e Histología está integrado por profesores de las dos áreas de conocimiento que le dan nombre, es decir, Histología y Biología Celular. Es un Departamento interfacultativo, ya que sus profesores están adscritos a tres centros en los que imparten docencia: Facultad de Medicina y Odontología, Facultad de Farmacia y Facultad de Ciencia y Tecnología.

El Departamento se creó con la denominación de Departamento de Biología Celular y Ciencias Morfológicas, pero la desaparición de esta última área de conocimiento y la creación del área de Histología dio lugar a su denominación actual.

El Departamento se rige por el Reglamento Marco de Departamentos de la UPV/EHU.