Los estudiantes del Campus de Gipuzkoa disponen de dos espacios para aparcar de forma gratuita en parcelas pertenecientes a la UPV/EHU. Para acceder a ellos el alumnado ha de acercar la tarjeta universitaria al lector de tarjetas.
El Ayuntamiento de San Sebastián ofrece al personal y alumnado de la UPV/EHU la posibilidad de estacionar el coche en zona OTA sin límite de hora en el mismo día y con reducción en la tasa a abonar. Para ello, es necesario pasar la tarjeta universitaria por el lector disponible para el pago de la OTA ordinaria.
Además, cualquier miembro de la comunidad universitaria puede hacer uso de los espacios habilitados para 'vehículos de alta ocupación'. Para aparcar en esta zona, es necesario que al menos dos personas empleen el vehículo y pasen dos tarjetas universitarias por el lector disponible para el pago de la OTA ordinaria.