El máster tiene una finalidad investigadora en materias dirigidas al logro de una  mayor vigencia y realización de los derechos fundamentales teniendo en cuenta los diferentes instrumentos de tutela judicial de estos derechos.

Para ello, se aborda el análisis del régimen jurídico de los servicios públicos prestados por las diferentes Administraciones para la satisfacción de los derechos fundamentales, las políticas sociales desarrolladas por los poderes públicos y los concretos instrumentos de tutela judicial que en el ámbito internacional, europeo e interno se han desarrollado.

Además, se trabaja el impacto que el auge de las nuevas tecnologías ha tenido sobre los derechos fundamentales, como la incidencia en el derecho a la intimidad, la inviolabilidad del domicilio y el secreto de las comunicaciones, entre otros.

El Máster en Derechos Fundamentales y Poderes Públicos tiene una duración anual, aunque se oferta la posibilidad de realizarlo en dos cursos, para así facilitar su realización a quienes trabajan. Participan profesores de diversas Universidades Europeas, especialistas en la materia. Además, da acceso a programas de doctorado.

La metodología desarrollada en el master persigue el análisis teórico de los derechos humanos, el análisis práctico de la jurisprudencia de los diferentes tribunales existentes en esta materia, y parte de una concepción participativa en la elaboración de las políticas de derechos humanos. La metodología docente que se contempla para el desarrollo del master es la siguiente: 1) Exposición escrita del contenido de las categorías jurídicas fundamentales sobre derechos fundamentales2) Seminarios de análisis de los derechos humanos y la jurisprudencia desarrollada. 3) Casos prácticos y síntesis de las categorías y estudios desarrollados en materia de derechos humanos. 4) Aplicación de las técnicas y casos analizados de nuevos problemas. 5) Realización de actividades individuales y, en su caso, de grupo, en el desarrollo del master

El TFM, cuya realización equivale a 12 créditos ECTS, se realiza una vez operadas el resto de materias del curso, iniciándose la elección del tema, recogida de materiales y planteamiento inicial durante el 2 cuatrimestre. El TFM persigue la elaboración de una investigación inédita, personal e innovadora, que aporte avances o nuevas ideas, reflexiones o síntesis de problemas jurídicos actualmente existentes. El TFM debe permitir la evaluación de las capacidades adquiridas por el alumno/a a lo largo de la enseñanza del máster. Entre sus características fundamentales estaría la de ser un trabajo autónomo, es decir fruto de la actividad científica del alumno/a. Debe ser un trabajo resolutivo, en el sentido de plantear soluciones o respuestas propias a los problemas planteados. El TFM requiere capacidad reflexiva, de análisis y consideración de los trabajos a analizar, así como la capacidad de pensar sobre problemas o cuestiones nuevas para el alumno o alumna. El TFM significa también la aplicación de las habilidades del alumno/a para poner y dar valor a los conocimientos que se han adquirido a lo largo del curso, de las diferentes materias estudiadas, comprobándose la capacidad del alumno/a para transmitir las conclusiones del trabajo así como la argumentación que fundamenta y permite llegar a dichas conclusiones. El TFM permite también comprobar las competencias que el o la estudiante deben tener en el campo de la investigación, es decir las habilidades que se desarrollan por los y las estudiantes en materia de investigación.Los TFMs serán sometidos a supervisión por el profesorado del máster, quien lo llevará a cabo de forma exigente y con una vinculación estrecha a la labor del alumno/a. El profesorado del máster será asignado a estas funciones de acuerdo con la especialización y líneas de investigación en correspondencia con las características del trabajo de investigación plantado por el alumno/a.