El Grupo está estructurado en tres líneas de investigación interdependientes:
1) «Epidemiología, patogenia y diagnóstico de las candidiasis y otras infecciones asociadas a biopelículas» (director: Guillermo Quindós). El trabajo de la línea incluye el estudio de la patogenia de las candidiasis y otras enfermedades asociadas a biopelículas, con el desarrollo de la metodología de estudio de las biopelículas microbianas en diferentes biomateriales, el desarrollo y valoración de la metodología de diagnóstico de estas infecciones basada en el aislamiento diferencial, en las propiedades bioquímicas, enzimáticas o inmunológicas, sondas de ADN o en métodos moleculares para la identificación y tipificación epidemiológica de los aislamientos clínicos de microorganismos patógenos.
2) «Modelos in vivo para el estudio de la patogenicidad y la sensibilidad a fármacos antimicrobianos de Candida y de otros patógenos productores de biopelículas» (directora: Elena Eraso). Esta línea está enfocada en la utilización de modelos experimentales en animales invertebrados para el estudio de la virulencia de Candida, la evaluación de la eficacia de los fármacos en el tratamiento de las micosis y la búsqueda de alternativas terapéuticas. Galleria mellonella y Caenorhabditis elegans presentan ventajas sobre los modelos en mamíferos por su fácil mantenimiento, la utilización de una población significativa con un coste bajo, el pequeño tamaño o su corta vida.