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Estudio de expresión genética de Aspergillus fumigatus durante la infección en modelos experimentales de cultivo celular para definir la patogénesis de este hongo y seleccionar dianas de diagnóstico rápido y desarrollo de nuevos antifúngicos.

Doctoral student:
Xabier Guruceaga Sierra
Year:
2017
University:
UPV/EHU
Director(s):
Aitor Rementeria
Description:

Aspergillus fumigatus es considerado como el patógeno fúngico de transmisión aérea más importante siendo el agente etiológico de enfermedades que varían desde alergias hasta la aspergilosis invasora (AI), que afecta principalmente a pacientes inmunocomprometidos, con tasas de mortalidad que varían entre el 50% y el 95%. Esta mortalidad puede ser debida al retraso diagnóstico, la debilidad de los pacientes, o al tratamiento antifúngico no efectivo. La capacidad patogénica de esta especie depende del estado inmune del hospedador y de las características del propio hongo.

El objetivo es estudiar los mecanismos de patogenicidad que se activan diferencialmente en A. fumigatus al inicio, durante el desarrollo de una infección, y en condiciones estresantes como tratamientos antifúngicos. El estudio se realizará con la utilización de un de un microarray de expresión de genoma completo del hongo, Fumigatus vers.1 (Agilent), y que se ensayó en cultivos del hongo con resultados que están siendo evaluados actualmente.

Para el estudio del transcriptoma completo del hongo en las diferentes condiciones utilizaremos modelos de infección en cultivo celular, cuyo uso permitirá limitar el empleo de infecciones experimentales en modelos animales al mínimo imprescindible. Además, permitirá una estandarización de los estudios para la evaluación de los transcriptomas. El análisis de los datos obtenidos permitirá detectar la expresión génica diferencial del hongo frente al estrés, mejorar la comprensión de su patogénesis, y detectar dianas de diagnóstico rápido o para el desarrollo de nuevos antifúngicos.

Los resultados obtenidos se validarán mediante técnicas de retrotranscripción y desarrollo sistemas de detección específica mediante PCR a tiempo real para las dianas génicas más interesantes, mediante el estudio del secretoma fúngico con técnicas proteómicas. Por último, se validarán los resultados en infecciones animales.

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