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Evolución Humana
Práctica 1. La filogenia Primate. Resultados
Orden Primate
Cinco algoritmos
Se han obtenido cinco árboles del orden Primate, mediante cinco diferentes algoritmos. Se discuten algunos de sus aspectos más controvertidos:
El árbol obtenido mediante el método de Máxima Verosimilitud (Fig. 1) muestra a Tarsius alejado del resto de primates. Los dos Dermoptera aparecen situados entre Strepsirrhini y Haplorrhini. Ambas circunstancias sugieren que en este caso el método no ha obtenido resultados fiables.
Figura 1. Árbol del orden Primate obtenido mediante el método de Máxima Verosimilitud.
En el árbol obtenido mediante el método de Unión de Vecinos (Fig 2), Tarsius aparece bien clasificado, pero los dos Dermoptera aparecen situados entre Strepsirrhini y Haplorrhini. Por ello, el método no parece el más adecuado.
Figura 2 . Árbol del orden Primate obtenido mediante el método de Unión de Vecinos.
En el árbol obtenido mediante el método de Evolución Mínima (Fig 3), Tarsius aparece bien clasificado, así como los dos Dermoptera, pero Homo aparece más próximo a Gorilla que a Pan. Por ello, este método no es considerado el más adecuado.
Figura 3 . Árbol del orden Primate obtenido mediante el método de Evolución Mínima.
En el árbol obtenido mediante el método UPGMA (Fig 4), Tarsius aparece lejos de su lugar esperado. Por ello, este método no es considerado el más adecuado.
Figura 4 . Árbol del orden Primate obtenido mediante el método UPGMA.
En el árbol obtenido mediante el método de Máxima Parsimonia (Fig 5) no se ha encontrado ninguna incoherencia, por lo que ha sido el método seleccionado como el más adecuado en este caso.
Figura 5. Árbol del orden Primate obtenido mediante el método de Máxima Parsimonia.
Bootstrap
Utilizando el método seleccionado en el apartado anterior (Máxima Parsimonia) y realizando un análisis bootstrap con 100 repeticiones, se han observado en general valores altos. Esto en principio es bastante lógico, puesto que se comparan una serie de taxones bien definidos, por lo que hay un bajo grado de incertidumbre. Hay en todo caso alguna excepción, como la rama que une a Hylobates y Symphalangus con Nomascus. De hecho, en el apartado dedicado al nivel de especie en Catarrinos (Fig 9) Hylobates y Nomascus aparecen más emparentados entre sí.
Figura 6. Árbol del orden Primate obtenido mediante el método de Máxima Parsimonia con valores bootstrap. Los valores se muestran en tanto por ciento.
Strepsirrhini
A continuación se realizó un árbol considerando 42 especies de Strepsirrhini (Fig 7).
Figura 7. Árbol de Strepsirrhini obtenido mediante el método de Máxima Parsimonia a partir de 42 especies.
Haplorrhini
Platyrrhini
En la figura 8 se muestra el árbol obtenido para un grupo de 64 especies de platirrinos.
Figura 8. Árbol de Platyrrhini obtenido mediante el método de Máxima Parsimonia a partir de 64 especies.
Catarrhini
Por último, se ha obtenido un árbol con 78 especies de catarrinos (Fig 9).
Figura 9. Árbol de Catarrhini obtenido mediante el método de Máxima Parsimonia a partir de 78 especies.
@Jose A. Peña, 2020, UPV/EHU