MCCCS Towhee 7.0.2

Software_eu

Towhee Monte Carlo kode libre bat da. Simulazio molekularrak egiten ditu atomoetan oinarritutako indar eremuak erabiliz.

 

Informazio orokorra

Towheek hainbat talde termodinamiko estatistiko  (NVT, NPT, UVT, NVT eta NPT) simulatu ditzake, eta Monte Carloerabiliz . (Informazio gehiago).

 

Nola erabili

send_towhee

  • Towhee ilarara bidaltzeko   send_lmp tresna sortu dugu. Komando sintaxia, honakoa da:
  • send_towhee OUT NODES PROCS_PER_NODE TIME [ MEM ] [``Other queue options'' ]
JOBNAME: Outputaren izana da
NODES: Nodo kopurua.
PROCS: Prozesagailu kopurua
TIME: Kolari eskatutako denbora hh:mm:ss formatuan.
MEM: Aukerakoal. Memoria  Gb-etan( 1GB/core-ko esleituko du adierazten ez bada).
[``Other Torque Options'' ] Optional. Kola sistemari adierazi nahi zaizkion beste hainbat aukera.
Ikus azpian adibidea..   More information about this options

Adibideak

  • OUT izango da output.a.   Lana nodo batera eta 4 prozesagailuetara bidali dugu, 4 ordutarako:
    • send_towhee OUT 1 4 04:00:00
  • Lana  2 nodo eta 8 prozesagailutara  eskatutako denbora  192 ordutakoa izanik. Memoria ere adierazi dugu,  8 GB, eta lana ez da 1234.  lana amaitu aurretik martxan jarriko.
    • send_towhee out 2 8 192:00:00 8 ``-W depend=afterany:1234'
  • Lana 4 nodo eta 4 prozesagailuetara bidali dugu. 200 ordu eta 2 GB-etako RAM-a askatu dugu. Gainera, kalkulua hasi eta amaitzean email bat bidaliko digu adierazitako emailera .
    • send_towhee OUT 4 4 200:00:00 2 ``-m be -M mi.email@ehu.es''

    Lanen Monitorizazioa

    Towhee  lanaen jarraipena egiteko  remote_vi tresna erabili daiteke.

    remote_vi JOBID

    send_towhee-n adierazitako output  fitxategia erakutsiko digu.  (Lana send_towhee-rekin bidali bada soilik).

    Informazio gehiago

    http://towhee.sourceforge.net