Informazio orokorra
USEARCH is a unique sequence analysis tool that offers search and clustering algorithms that are often orders of magnitude faster than BLAST. Tenemos la versión de 32 bits que es gratuita, pero no distribuible a terceros. Tiene la limitación de 4 GB de RAM como máximo.
Cómo usar
USEARCH erabiltzeko erabili ondorengo komandoa
/software/bin/usearch
adibidez
usearch -cluster_otus data.fa -otus otus.fa -uparseout out.up -relabel OTU_ -sizein -sizeout
Momentuz USEARCH xeon20 etiketa duten nodoetan dago eskuragarri
QIIME
USEARCH [intlink id=”7758″ type=”post”]QIIME[/intlink]-pean erabili daiteke
Informazio gehiago
[intlink id=”7686″ type=”post”]QIIME[/intlink].