WIEN2k programak fitxero berezia erabiltzen du lanak koletara bidaltzeko. Script hau bidaltzeko erabili
qsub script_file
run_lapw programa paraleloa egikaritzen duen scriptaren plantilla
#!/bin/bash #PBS -l nodes=[val]:ppn=[val] #PBS -l walltime=[val] #PBS -l mem=[val] # Vamos a nuestro home cd $PBS_O_WORKDIR #Creamos el fichero .machines cat $PBS_NODEFILE |cut -c1-6 >.machines_current aa=$(wc -l .machines_current |cut -d " " -f 1) echo '#' > .machines i=1 while [ $i -le $aa ];do echo -n '1:' >>.machines head -$i .machines_current |tail -1 >> .machines let i=i+1 done echo 'granularity:1' >>.machines echo 'extrafine:1' >>.machines #Nuestro directorio de scratch scrt=/scratch/$USER/$(echo $PBS_O_WORKDIR |xargs basename) outdir=bukatuta_$PBS_JOBID export SCRATCH=$scrt/scratch #Creamos el directorio mkdir $scrt mkdir $scrt/scratch #Copiamos los archivos al directorio scratch #Usaremos cp -r $scrt para copiar también subdirectorios. cp $PBS_O_WORKDIR/* $scrt cp .machines $scrt #Nos movemos de directorio cd $scrt #Ejecutamos WIEN2k en paralelo run_lapw -p #Movemos los archivos finales mkdir $PBS_O_WORKDIR/$outdir mv -f $scrt/* $PBS_O_WORKDIR/$outdir mv -f $scrt/.machines $PBS_O_WORKDIR/$outdir #Borramos el directorio rmdir $scrt rm .??*
#PBS-rekin hasten diren lerroak ilara-kudeatzailearentzako aginduak dira; hauek aukeratzen dituzte:
nodes: [opcional] Kalkulu-nodoa aukeratzeko erabil daiteke (adibidea: [name]=cn14).
mem: Kalkulatzeko gordetako RAM memoria, mb edo gb-tan neurtua (adibide: [val]=100mb).
walltime: Mikroprozesadorean erreserbatutako denbora, ordua/minutua/segundoa formatuan (adibidea: [val]=24:00:00).
#-rekin hasten diren gainerako lerroak komentarioak dira.
Scriptean $USER aldagaiak erabiltzailearen izena bueltatzen du, $PBS_O_WORKDIR aldagaiak qsub agindua exekutatzen den lan-direktorioa eta $PBS_JOBID aldagaiak lanaren identifikazio-zenbakia.