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Introduction Next Generation Sequencers produce a very large set of short DNA sequences that must be assembled to produce larger and useful sequences. ABySS and velvet are programs used to perform this assembly. In this article we compare both programs from the point of view of their performance, because for large data sets we […]
Introducción El BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) es un algoritmo y un programa informático de alineamiento de secuencias de tipo local, ya sea de ADN o de proteínas, empleado en bioinformática. El programa es capaz de comparar una secuencia problema contra una gran cantidad de secuencias que se encuentren en una base de […]
Curso de especial interés para desarrolladores de código de aplicaciones científicas en Fortran. El periodo para reservar plaza está abierto hasta el 1 de marzo. Las plazas son limitadas. Para realizar la reserva de plaza debe de darse de alta en el sitio web del Centro a través del formulario https://www.cesga.es/es/registro Cuando y dónde […]
Schrödinger Workshop “Computational Drug Discovery” Madrid, Spain Thursday February 23, 2012 at the CSIC Schrödinger Applications Scientist Jas Bhachoo will be hosting a workshop from 9.30 to 17.00 on Thursday February 23, 2012 at the CSIC Madrid in Spain. This workshop has been designed for intermediate-advanced users and organized in collaboration with Dra Sonia […]
El Servicio General de Informática Aplicada a la Investigación (Cálculo Científico) -IZO/SGI- dentro el marco del contrato firmado con el CIC-nanoGUNE ha ampliado sus recursos computacionales. La ampliación consta de 648 nuevos cores de computación, una ampliación del sistema de archivos paralelo para cálculo hasta los 22 TB y una ampliación adquirida por el […]
The Service of Informatics applied to the research (Scientific Computing) -IZO/SGI- in the framework of the contract signed with CIC-nanoGUNE has increased its computational resources. The increase consist in new 648 computation cores, an extension of the parallel filesystem up to 22 TB and a new /home with 5.6 TB. In detail, 54 computing […] Ikerkuntzari zuzendutako Informatikako Zerbitzuak (Kalkulo Zientifikoa) -IZO/SGI- CIC-nanoGUNErekin sinatutako kontratuaren barruan bere baliabide konputazionalak handitu ditu. 648 kore berri erosi dira, kalkulurako erabiltzen den eraginkortasun handiko fitxategi sistema paraleloa ere 7 Gb-etatik 22 TBetaraino handitu da eta IZO-SGI-ak 5.6 TBetakoa /home berria erosi du ere. Zehatzagoak izatearren 54 conputazio nodo erosi dira. Bakoitzak bi prozesagailu […]
Este es el título de un artículo publicado por Matlab en su revista electrónica Matlab Digest. Muestran lo relativamente sencillo que puede ser usar las GPUs desde Matlab aplicándolo al ejemplo de la evolución de ondas bidimensionales. De forma más general, mencionan el mayor problema actual para el uso de GPUs, que es la […]
El Servicio de Informática Aplicada a la Investigación (Cálculo Científico) IZO-SGI ha publicado la memoria del 2010
La memoria completa puede encontrarse en el siguiente enlace Memoria del 2010 del IZO-SGI(pdf)
El IZO-SGI de un vistazo 2009 2010 Cores de cálculo 440 872 Cores de cálculo (Arina) 320 752 Horas de […]
The Computing Service (IZO-SGI) of the UPV/EHU has published the report of the 2010 year.
The complete report in Spanish can be found in the following link IZO-SGI 2010 year report (pdf)
The IZO-SGI Computing Service at a glance 2009 2010 Computing cores 440 872 Computing cores (Arina) 320 […] |
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